Os principais cortes são: Longitudinal=> Corte vertical e total realizado ao meio da estrutura em direção vertical. Permite a visualização de tecidos internos. Paradérmico => Corte horizontal e superficial, permitindo por isso a observação de tecidos mais externos.
O propósito da fixação é preservar uma amostra de material biológico (tecidos ou células) o mais próximo ao seu estado natural como possível no processos de preparação do tecido para exame. Para atingir esta meta, diversas condições devem ser normalmente encontradas.
A utilidade da coloração para a observação ao microscópio é facilitar que a luz enviada seja melhor refletida. Como o funcionamento do microscópio eletrônico se dá ao "envio" de uma luz para as partículas e, essa luz refletida nelas volta para o microscópio, a coloração ajuda a obter um melhor reflexo.
Tubo → parte que conecta a ocular às lentes objetivas. Estativa, braço ou coluna → parte que conecta o tubo à base do microscópio. Dispositivo macrométrico → estabelece um foco geral para a amostra analisada. Dispositivo micrométrico → estabelece um foco mais preciso e aumenta o detalhe da amostra analisada.